MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium smegmatis JS623 plasmid pMYCSM03

Total Repeats: 3978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019959	GCC	2	6	60	65	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644685
2	NC_019959	CCGC	2	8	82	89	0 %	0 %	25 %	75 %	433644685
3	NC_019959	CGC	2	6	120	125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644685
4	NC_019959	CGT	2	6	135	140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644685
5	NC_019959	CCG	2	6	165	170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644685
6	NC_019959	CGG	2	6	249	254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644685
7	NC_019959	GC	3	6	260	265	0 %	0 %	50 %	50 %	433644685
8	NC_019959	CTG	2	6	315	320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644686
9	NC_019959	CAC	2	6	330	335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644686
10	NC_019959	GCCG	2	8	337	344	0 %	0 %	50 %	50 %	433644686
11	NC_019959	CGC	3	9	350	358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644686
12	NC_019959	GCGCG	2	10	368	377	0 %	0 %	60 %	40 %	433644686
13	NC_019959	CTCACG	2	12	390	401	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	433644686
14	NC_019959	TTC	2	6	406	411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433644686
15	NC_019959	CGC	2	6	560	565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644686
16	NC_019959	GGT	2	6	677	682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644686
17	NC_019959	ACG	2	6	698	703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644686
18	NC_019959	CGG	2	6	816	821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644687
19	NC_019959	GCT	2	6	850	855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644687
20	NC_019959	CCG	2	6	874	879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644687
21	NC_019959	GGTCAG	2	12	947	958	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	433644687
22	NC_019959	CAT	2	6	959	964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644687
23	NC_019959	GC	3	6	967	972	0 %	0 %	50 %	50 %	433644687
24	NC_019959	GCC	2	6	1050	1055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644687
25	NC_019959	GCC	2	6	1136	1141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644687
26	NC_019959	ACC	2	6	1145	1150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644687
27	NC_019959	AGC	2	6	1158	1163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644687
28	NC_019959	CAG	2	6	1271	1276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644687
29	NC_019959	GCCGC	2	10	1333	1342	0 %	0 %	40 %	60 %	433644687
30	NC_019959	TGG	2	6	1363	1368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644687
31	NC_019959	CGC	2	6	1400	1405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644687
32	NC_019959	CG	3	6	1465	1470	0 %	0 %	50 %	50 %	433644688
33	NC_019959	GCA	2	6	1632	1637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644688
34	NC_019959	CGGC	2	8	1645	1652	0 %	0 %	50 %	50 %	433644688
35	NC_019959	CCGC	2	8	1701	1708	0 %	0 %	25 %	75 %	433644688
36	NC_019959	CTG	2	6	1717	1722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644688
37	NC_019959	GGC	2	6	1806	1811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644689
38	NC_019959	CCCGC	2	10	1814	1823	0 %	0 %	20 %	80 %	433644689
39	NC_019959	CCG	2	6	1853	1858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644689
40	NC_019959	CGT	2	6	1868	1873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644689
41	NC_019959	AAC	2	6	1915	1920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433644689
42	NC_019959	CGG	2	6	1964	1969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644689
43	NC_019959	CTG	2	6	2001	2006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644689
44	NC_019959	GGC	2	6	2049	2054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644689
45	NC_019959	TCG	2	6	2104	2109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644689
46	NC_019959	TGG	2	6	2212	2217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644689
47	NC_019959	TGG	2	6	2237	2242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644689
48	NC_019959	CAG	2	6	2256	2261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644689
49	NC_019959	CCG	2	6	2284	2289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644690
50	NC_019959	CGCA	2	8	2310	2317	25 %	0 %	25 %	50 %	433644690
51	NC_019959	ACGC	2	8	2343	2350	25 %	0 %	25 %	50 %	433644690
52	NC_019959	GCT	2	6	2425	2430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644690
53	NC_019959	GTC	2	6	2447	2452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644690
54	NC_019959	CG	3	6	2516	2521	0 %	0 %	50 %	50 %	433644690
55	NC_019959	GTC	2	6	2854	2859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644691
56	NC_019959	GCG	2	6	2878	2883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644691
57	NC_019959	GC	3	6	2899	2904	0 %	0 %	50 %	50 %	433644691
58	NC_019959	CGT	2	6	2937	2942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644691
59	NC_019959	GCG	3	9	3023	3031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644691
60	NC_019959	TGC	2	6	3059	3064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644691
61	NC_019959	GGC	2	6	3073	3078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644691
62	NC_019959	CCA	2	6	3079	3084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644691
63	NC_019959	GCT	2	6	3111	3116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644691
64	NC_019959	GCA	2	6	3186	3191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644691
65	NC_019959	GGTC	2	8	3192	3199	0 %	25 %	50 %	25 %	433644691
66	NC_019959	GGT	2	6	3214	3219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644691
67	NC_019959	GCC	2	6	3237	3242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644691
68	NC_019959	GTC	2	6	3292	3297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644691
69	NC_019959	CGG	2	6	3302	3307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644691
70	NC_019959	CGA	2	6	3315	3320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644691
71	NC_019959	CCA	2	6	3421	3426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644691
72	NC_019959	CGG	2	6	3447	3452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644691
73	NC_019959	GCGA	2	8	3459	3466	25 %	0 %	50 %	25 %	433644691
74	NC_019959	CGT	2	6	3480	3485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644691
75	NC_019959	CGC	2	6	3679	3684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644692
76	NC_019959	CCG	2	6	3699	3704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644692
77	NC_019959	TCG	2	6	3744	3749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644692
78	NC_019959	CGC	2	6	3786	3791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644692
79	NC_019959	GGCC	2	8	3822	3829	0 %	0 %	50 %	50 %	433644692
80	NC_019959	CTG	2	6	3850	3855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644692
81	NC_019959	CCCG	2	8	3906	3913	0 %	0 %	25 %	75 %	433644692
82	NC_019959	GGCCGC	2	12	3969	3980	0 %	0 %	50 %	50 %	433644692
83	NC_019959	ACC	2	6	3991	3996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644692
84	NC_019959	GC	3	6	4014	4019	0 %	0 %	50 %	50 %	433644692
85	NC_019959	GACC	2	8	4032	4039	25 %	0 %	25 %	50 %	433644692
86	NC_019959	GCC	2	6	4093	4098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644692
87	NC_019959	TCG	4	12	4546	4557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644693
88	NC_019959	CGACC	2	10	4577	4586	20 %	0 %	20 %	60 %	433644693
89	NC_019959	CCGC	2	8	4588	4595	0 %	0 %	25 %	75 %	433644693
90	NC_019959	CGC	2	6	4607	4612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644693
91	NC_019959	CTCACC	2	12	4614	4625	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	433644693
92	NC_019959	GCC	2	6	4629	4634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644693
93	NC_019959	CCCA	2	8	4686	4693	25 %	0 %	0 %	75 %	433644693
94	NC_019959	GGCC	2	8	4721	4728	0 %	0 %	50 %	50 %	433644693
95	NC_019959	CTG	2	6	4767	4772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644693
96	NC_019959	CGC	2	6	4823	4828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644693
97	NC_019959	CGC	2	6	4836	4841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644693
98	NC_019959	GCG	2	6	4843	4848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644693
99	NC_019959	AGCCTG	2	12	4917	4928	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433644693
100	NC_019959	CGC	2	6	4937	4942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644693
101	NC_019959	CAG	2	6	4956	4961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644693
102	NC_019959	ACG	2	6	4972	4977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644693
103	NC_019959	CGA	2	6	4982	4987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644693
104	NC_019959	GCC	2	6	5001	5006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644693
105	NC_019959	CG	3	6	5014	5019	0 %	0 %	50 %	50 %	433644693
106	NC_019959	CGC	2	6	5030	5035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644693
107	NC_019959	GCC	2	6	5078	5083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644693
108	NC_019959	CGG	2	6	5095	5100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644693
109	NC_019959	GCC	2	6	5108	5113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644693
110	NC_019959	TG	3	6	5138	5143	0 %	50 %	50 %	0 %	433644694
111	NC_019959	TCACGC	2	12	5279	5290	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	433644694
112	NC_019959	CGT	2	6	5379	5384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644694
113	NC_019959	GGC	2	6	5507	5512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644695
114	NC_019959	CGG	2	6	5590	5595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644695
115	NC_019959	CGC	2	6	5600	5605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644695
116	NC_019959	CGA	2	6	5645	5650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644695
117	NC_019959	GCG	2	6	5827	5832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644695
118	NC_019959	CAG	2	6	5873	5878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644695
119	NC_019959	ACC	2	6	5896	5901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644695
120	NC_019959	GCC	2	6	5956	5961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644695
121	NC_019959	CGA	2	6	5981	5986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644695
122	NC_019959	TCG	2	6	5989	5994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644695
123	NC_019959	CCGGC	2	10	6001	6010	0 %	0 %	40 %	60 %	433644695
124	NC_019959	CG	3	6	6015	6020	0 %	0 %	50 %	50 %	433644695
125	NC_019959	CGA	2	6	6038	6043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644695
126	NC_019959	CAC	2	6	6119	6124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644695
127	NC_019959	GCAGA	2	10	6126	6135	40 %	0 %	40 %	20 %	433644695
128	NC_019959	ACCGCA	2	12	6138	6149	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	433644695
129	NC_019959	GCA	3	9	6174	6182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644695
130	NC_019959	CCG	2	6	6193	6198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644696
131	NC_019959	CAT	2	6	6211	6216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644696
132	NC_019959	CAC	2	6	6217	6222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644696
133	NC_019959	CGC	2	6	6232	6237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644696
134	NC_019959	GCT	2	6	6240	6245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644696
135	NC_019959	ACT	2	6	6297	6302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644696
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137	NC_019959	CGC	2	6	6329	6334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644697
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155	NC_019959	CGA	2	6	7151	7156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644698
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250	NC_019959	CAA	2	6	10091	10096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433644701
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253	NC_019959	GTT	2	6	10288	10293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433644701
254	NC_019959	GCG	3	9	10299	10307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644701
255	NC_019959	TG	3	6	10422	10427	0 %	50 %	50 %	0 %	433644701
256	NC_019959	ACG	2	6	10431	10436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644701
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258	NC_019959	ACG	2	6	10569	10574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644701
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260	NC_019959	CCG	2	6	10603	10608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644701
261	NC_019959	CGA	2	6	10648	10653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644701
262	NC_019959	GGT	2	6	10676	10681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644701
263	NC_019959	CGA	2	6	10702	10707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644701
264	NC_019959	TGT	2	6	10747	10752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433644701
265	NC_019959	GC	3	6	10793	10798	0 %	0 %	50 %	50 %	433644701
266	NC_019959	TGCCC	2	10	10810	10819	0 %	20 %	20 %	60 %	433644701
267	NC_019959	ATG	2	6	10824	10829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644701
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269	NC_019959	GTCGAC	2	12	10850	10861	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433644701
270	NC_019959	CGC	2	6	10901	10906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644701
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363	NC_019959	TGC	2	6	14402	14407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644702
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373	NC_019959	TCC	2	6	14791	14796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433644702
374	NC_019959	CGGAA	2	10	14803	14812	40 %	0 %	40 %	20 %	433644702
375	NC_019959	AGC	2	6	14821	14826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644702
376	NC_019959	CGCGA	2	10	14827	14836	20 %	0 %	40 %	40 %	433644702
377	NC_019959	GCA	2	6	14900	14905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644702
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379	NC_019959	TTG	2	6	14968	14973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433644702
380	NC_019959	ATC	2	6	15048	15053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644702
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382	NC_019959	ATG	2	6	15124	15129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644702
383	NC_019959	ATC	2	6	15205	15210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644702
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500	NC_019959	TCA	2	6	20249	20254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644705

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